单细胞测序数据分析与研究思路实战培训已截止报名
推荐参加：世界中医药学会联合会中医特色诊疗研究专业委员会第16届中医特色诊疗国际学术年会

课程时间： 2021-01-23 09:00至 2021-01-24 18:00结束

课程地点：线上活动

会议规模：50人

主办单位：医小白科研培训平台

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会议通知
会议内容主办方介绍

单细胞测序数据分析与研究思路实战培训宣传图

背景介绍：

单细胞测序是从单个细胞水平对基因组和转录组进行研究。2015年以来，10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现，彻底降低了单细胞测序的成本门槛。自此，单细胞测序技术被广泛应用于基础科研和临床研究。通过单细胞测序可以最大程度的反映细胞的异质性，发现新的细胞群和细胞亚群，并为阐明细胞状态转换的调控机理提供了技术保障。目前在公共数据库中的单细胞测序几乎都围绕常见模式生物来做。人，小鼠，斑马鱼等，涉及正常组织、血液、不同发育阶段样本，疾病类型也各种各样包括肿瘤、免疫细胞、炎症类甚至包括较难研究的神经、肌肉、骨骼等。最重要的是，这些数据一直在增加。是现今生命科学研究的焦点。

时间地点：

2021年1月23日—1月24日腾讯课堂

课程特点：

本次课程以近期CNS文章为案例主线，逐一详细剖析，全程电脑实战教学。理论与实践相结合，老师将以最简单易懂的方式，既介绍单细胞测序的研究方法、分析内容和最新前沿进展，又介绍具体的数据库、工具和软件的使用，并在课堂上进行上机指导。讲师经验丰富，教学深入浅出，能让大家获得从单细胞组学原始数据实现CNS图形绘制的实战能力。让每一个接受培训的学员能够从中真正获益。

授课专家：

本次授课老师来自中科院系统，长期从事单细胞多组学方面的项目研究，目前已在Nature等杂志发表文章四十多篇，承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。拥有丰富的科研技术经验，具有资深的技术底蕴和专业背景。

参会对象：

医学、生物、农业等专业的各级临床医生、药学、科研单位研究人员、高校硕/博研究生、对利用单细胞测序或公共数据库进行数据挖掘感兴趣的广大师生（尤其适合初学者和无基础的学员，无需任何基础，也无需学习任何编程语言）

医小白科研培训平台

会议日程（最终日程以会议现场为准）

课程安排：

课程安排
第一天上午	9:00-10:30	单细胞测序技术与应用	1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。
			2. 单细胞测序技术在科研领域的应用。
			3. 近年单细胞技术CNS文章思路解析。
	10:30-10:45	茶歇
	10:45-12:00	单细胞测序图标解读及思路	4. 单细胞文章常见图表解读。
			5. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物等领域的研究内容及思路。
	12:00-13:30	午餐及午休
第一天下午	13:30-15:30	Linux及R语言入门、软件安装	1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练。
			2. R语言简介及安装，RStudio的安装及使用说明。
			3. R语言语法介绍及常用命令。
	15:30-15:45
	15:45-17:00	R语言数据处理实操	4. 数据处理功能及统计应用。
			5. R语言画图实操：tSNE，小提琴图，热图，网络图，GO、KEGG富集图，GSEA等图形绘制。
	17:00-18:00	晚餐及休息
第一天晚上	18:00-21:00	单细胞转录组数据分析思路及流程	1. 单细胞高分文章分析思路解析（细胞类群确定、拟时间分析、差异表达、通路富集、转录因子、配体受体互作等）。
			2. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等软件及参数。
			3. 单细胞转录组转录因子、功能通路及配体受体互作思路解析。
			4. 单细胞组学分析常用数据库介绍及使用。
			5. 基因富集分析和可视化。
第二天上午	8:45-10:30	单细胞数据可视化、细胞分型	1. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操。
			2. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操。
			3. 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维。
	10:30-10:45	茶歇
	10:45-12:00	单细胞数据marker鉴定及差异分析	4. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。
			5. 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析。
	12:00-13:30	午餐及午休
第二天下午	13:30-15:00	单细胞数据轨迹分析，功能富集	1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析。
			2. 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析。
			3. 单细胞数据分析总结。
	15:00-15:15	茶歇
	15:15-17:00	单细胞数据挖掘思路及标书构思、准备	1. 归纳总结零成本单细胞数据挖掘思路。
			2. 单细胞测序基金申请思路、准备内容及注意事项等。
备注：上课主要软件为R和Rstudio，涉及部分Linux系统，讲师会详细带着操作；

会议嘉宾

即将更新，敬请期待

参会指南
会议门票

票种名称	价格	原价	票价说明
早鸟票	¥2600	¥2600	发票可开：培训费、资料费、会务费、会议注册费；
普通票	¥2800	¥2800	发票可开：培训费、资料费、会务费、会议注册费；
团购票	¥2500	¥2500	发票可开：培训费、资料费、会务费、会议注册费；