2019高通量数据库挖掘与网络图构建分析培训班(8月长春班)
时间:2019-08-03 09:00 至 2019-08-04 18:00
地点:长春
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2019高通量数据库挖掘与网络图构建分析培训班(8月长春班) 已截止报名会议时间: 2019-08-03 09:00至 2019-08-04 18:00结束 会议地点: 长春 海航长白山宾馆 长春市朝阳区新明大街1448号 周边酒店预订 主办单位: 上海遐永医药科技 医药加科研培训中心 上海遐锦生物科技有限公司
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会议介绍
会议内容 主办方介绍
2019高通量数据库挖掘与网络图构建分析培训班(8月长春班)宣传图
高通量数据库挖掘与网络图构建分析培训班
(吉林·长春 2019.8.3-4)
生物信息学(bioinformatics)定义:是在大分子方面的概念型的生物学,并且使用了信息学的技术,这包括了从应用数学、计算机科学以及统计学等学科衍生而来各种方法,并以此在大尺度上来理解和组织与生物大分子相关的信息。
培训目的:
很多老师都做过测序或者芯片实验,虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析,比如过滤、质控、比对、定量和差异等,但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析,并不能完整的讲一个故事!因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力,从海量信息中获得自己想要的关键基因!
培训预期:通过2天的培训,使学员掌握生信文献分析思路和8个实用操作知识点(具体见最后),可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。
生物信息学魅力:
帮助预测疾病相关的潜在基因,以及该基因潜在的作用靶点、上游调控转录因子等,从而指导实验方向、缩小试验范围、简化试验流程。
为基金申请提供支持,通过强大的信息数据的收集整理,减少投入增强研究目的性;且通过整合技术优势,指导提高临床诊断水平。
丰富的免费的数据资源和生物软件工具: 数据库:NCBI, EBI, DDBJ, PDB, SWISS-PROT等;软件工具:Cytoscape,BLAST, R语言,String, David等
案例:
我们可以看到该文献主要的分析步骤有:差异表达分析、聚类热图构建、GO和KEGG 通路分析、蛋白互作网络分析、生存曲线分析等。我们的主题基本上按照类似的文献思路进行讲解,和大家一起分享一下一篇SCI文章的生信分析步骤。
通过2~3天的学习,我们可以掌握一篇生信SCI文献的所有分析模块,并可以独立的结合自己的研究方向进行生信分析和数据挖掘,获得一套属于自己的分析结果。
培训时间:2019年8月3-4日,2日可报到(下午3点-晚上8点)
培训地点:长春市朝阳区新明大街1448号 海航长白山宾馆
报到地点:海航长白山宾馆
主办方:上海遐永医药科技有限公司
通过该主题的学习,可以学会:
高通量公共数据的详细信息查找/下载;
在线做差异表达分析
在线blast分析
基因ID转换
通路map图制作
功能富集分析
蛋白互作分析
网络图的构建和美化
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南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是专一服务于生命科学研究的专业技术型企业。是一大批志同道合的资深专业人士共同创办的具有现代化经营管理水平的生物高科技企业,从事生物技术产品的开发及销售,致力于将巴傲得生物打造成中国乃至世界一流的生物技术产品供应商。巴傲得生物长期备有Bioworld抗体现货4000多种抗体可以在一周左右送到客户的手里。精湛品质、合理价格、专业服务,是我们为您服务的宗旨。在细胞信号通路、免疫学、蛋白组学上拥有显著优势,其抗体产品、生长因子等为生命科学科研工作者提供了极大的便利。
医药加科研培训中心举办了2018肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议(12月北京班) 2019临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班(01.05-01.06北京班) 2019全国循证医学Meta分析及网状Meta三天精讲学习班(1月北京班) 第10期测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班2019(1月上海班) 2019肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议(1月上海班) 2019国自然基金标书构思与撰写学习班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班2019(1月上海班) 第8期医学SCI论文写作及发表技巧学习班2019(1月上海班) ......
上海遐锦生物科技有限公司上海遐锦生物科技有限公司于2019年11月29日举办全国循证医学Meta分析与网状Meta研讨会2019(11月上海班)会议。
会议日程 (最终日程以会议现场为准)
测序与芯片的高通量数据挖掘与分析课程大纲 |
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日期 |
时间 |
题目 |
课程内容 |
第一天 上午 |
9:00-10:45 |
基因数据库使用介绍 |
测序标准报告的解读 NCBI Gene:最权威的基因综合数据库之一。 NCBI GEO: 数据量最大的高通量公共数据库。 |
10:30-10:45 |
茶歇 |
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10:45-12:00 |
基因数据库使用介绍 |
GEO2R工具:在线做差异分析的R工具 bioDBnet:在线基因ID转换工具。 Uniprot: 最权威的蛋白综合数据库之一。 |
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12:00-13:30 |
午餐及午休 |
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第一天 下午 |
13:30-14:00 |
DAVID工具—功能富集分析
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功能富集的原理和意义 基因ID转换 |
14:00-15:30 |
基因功能注释(GO ,KEGG pathway) |
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基因功能富集(GO ,KEGG pathway) |
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基因功能聚类(GO ,KEGG pathway) |
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15:30-15:45 |
茶歇 |
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15:45-18:00 |
聚类热图及pathway map图 |
KEGG 数据库:最权威的通路数据库(pathway map 分析) |
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HEMI软件:构建聚类热图的本地软件 |
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第二天 上午 |
9:00-10:45 |
STRING工具——基因/蛋白相互作用分析(PPI) |
蛋白互作分析的原理和意义 |
单个蛋白的蛋白互作分析 |
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多个蛋白的蛋白互作分析 |
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STRING工具的使用步骤:输入、参数设置、输出等 |
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10:30-10:45 |
茶歇 |
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10:45-12:00 |
cytoscape网络做图软件(上) |
网络图构建 |
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逐个修改节点的属性和修改边的属性 |
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网络展示方式layout更美观 |
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网络统计分析 |
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12:00-13:30 |
午餐及午休 |
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第二天 下午 |
13:30-15:30 |
cytoscape网络做图软件(下) |
批量修改节点的属性和修改边的属性 |
Cytoscape的常用插件:ClusterONE |
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Cytoscape的常用插件:BinGO |
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15:30-15:45 |
茶歇 |
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15:45-16:30 |
课程总结 |
课程总结 |
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备注:建议携带电脑,方便跟随老师进行在线操作 |
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会议嘉宾 (最终出席嘉宾以会议现场为准)
讲师简介:
宋伟,交大生物信息学博士,参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
培训经历:在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。
培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等
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参会指南
会议门票 场馆介绍
收费标准:会务费:2800元每位(包含电子版教材、午餐,住宿费自理。)
优惠政策:
1. 提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料
2. 三人组团报名,每人优惠100元
3. 四人组团报名,每人优惠200元,
4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册!
可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。
注意事项:携带windows系统的电脑,苹果电脑请务必提前做好双系统。
房间价格:普通350/间,豪华380/间,需通过主办方预定
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交通指南:
交通状况:文化广场距离酒店1.6公里
南湖公园距离酒店0.2公里
人民广场距离酒店3.56公里
长春龙嘉国际机场距离酒店37.86公里
长春火车站距离酒店11公里
周围环境:南湖公园、动植物公园、文化广场
酒店地址:新民大街1448号
长春海航长白山宾馆集客房、餐饮、洗浴、娱乐为一体,设有豪华客房,中、西、韩、日式餐厅及豪华包房30多个。吉菜食府引领吉菜时尚,长白山珍宴采用长白山山珍为原料,精心烹制而成,极具吉林风情;咖啡苑、特色酒吧品位高雅;另有商务中心、多功能厅、国际会议厅、台球室、网球场、美容美发、桑拿、按摩、商场等配套设施,适合商务、旅游、会议、观光等多种需求。
长春海航长白山宾馆隶属于吉林省旅游集团,2002年6月21日,宾馆二十周年华诞同时荣膺旅游涉外宾馆,位于风景秀丽的南湖之滨,环境幽雅,交通便利。
长春海航长白山宾馆设有各类中小会议室、会见厅、国际会议可容纳200-300人,设备完善,为您提供满意服务。并配置了大屏幕、投影仪、幻灯机、白板、录音录像、电脑笔记本连接、横幅茶水等服务。
温馨提示
酒店与住宿:
为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
退款规则:
活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。
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