2020全转录组高通量测序&芯片数据生信分析（网络）研讨会已截止报名
推荐参加：世界中医药学会联合会中医特色诊疗研究专业委员会第16届中医特色诊疗国际学术年会

课程时间： 2020-06-08 08:00至 2020-07-01 18:00结束

课程地点：线上活动

主办单位：医药加科研培训中心上海遐永医药科技上海遐锦生物科技有限公司

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会议介绍
会议内容主办方介绍

2020全转录组高通量测序&芯片数据生信分析（网络）研讨会宣传图

全转录组高通量测序&芯片数据生信分析（网络）研讨会

医药加ZOOM网络会议室 2020年6月

【背景介绍】

2019年度国家自然基金医学科学部共批资助10138项目，批助金额总计441310万元。初步统计，这些项目中大部分都与编码基因有直接或间接的关联。其中，与通路（pathway）关联的有1349项，金额4.89亿；与miRNA相关的有630项，金额2.3亿；与lncRNA相关的有395项，金额1.45亿；

如何获得有创新意义的疾病靶标基因（mRNA，lncRNA，circRNA，miRNA等）是项目申请及文章写作时最常见的问题。因此我们基于全转录组数据分析的思路，把RNA层面的mRNA、LncRNA、circRNA和miRNA等分子分别给大家做一个分析实操，以及整合这几个RNA的分析思路（具体参见课程表）。

为了适应生物医药科研工作者的学习效率，我们开展了此次训练营培训班。周期是4周，每周两个晚上，这样完全不影响正常工作。共通过8个晚上（3h/晚，19点~22点）的学习，我们了解全转录组RNA分子的生信分析思路对项目及文章的帮助，以及实操常见的数据库、在线工具和本地软件。使得学员可以自己完成一个完整的分析报告并获得疾病相关的靶标基因。

2020全转录组高通量测序&芯片数据生信分析（网络）研讨会

项目类型	题目	金额/万元
重点项目	FXYD3介导的信号网络对肠道黏膜免疫稳态的调控研究	300
重点项目	基于蛋白-蛋白相互作用精准调节转录因子Nrf2活性及探索其作为肝细胞癌治疗的新靶标	298
重点项目	miR-23b/24-1簇防治烧伤后脓毒症所致MODS的系统研究	297
面上项目	LZTR1基因突变导致的RAS/MAPK通路过度激活以及Noonan综合征相关肥厚型心肌病的机制研究	60
面上项目	SUGP2基因及其突变在遗传性血色病中的致病作用及其机制研究	60
面上项目	WDR73基因突变在Galloway-Mowat综合征中的致病机制研究	60
面上项目	STAG2通过ERK/AKT/GSK3β/c-Myc反馈通路调节甲状腺癌谷氨酰胺代谢的机制研究	60
面上项目	LncRNA FOXF1靶向调控动力相关蛋白1表达在缺氧诱发肺动脉内皮细胞焦亡中的作用及分子机制	55

主办方：上海循掘生物科技中心

会议时间：2020年6月（8个晚上）

6月8、10、15、17、22、24、29日，7月1日，8晚，每晚19：00-22：00 3小时

会议地点：医药加ZOOM网络会议室

说明：研讨会使用专业会议软件ZOOM，需提前安装好

医药加科研培训中心

举办了2018肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议（12月北京班） 2019临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班（01.05-01.06北京班） 2019全国循证医学Meta分析及网状Meta三天精讲学习班（1月北京班）第10期测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班2019（1月上海班） 2019肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议（1月上海班） 2019国自然基金标书构思与撰写学习班（1月上海班） TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班2019（1月上海班）第8期医学SCI论文写作及发表技巧学习班2019（1月上海班） ......

上海遐永医药科技

南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd），是专一服务于生命科学研究的专业技术型企业。是一大批志同道合的资深专业人士共同创办的具有现代化经营管理水平的生物高科技企业，从事生物技术产品的开发及销售，致力于将巴傲得生物打造成中国乃至世界一流的生物技术产品供应商。巴傲得生物长期备有Bioworld抗体现货4000多种抗体可以在一周左右送到客户的手里。精湛品质、合理价格、专业服务，是我们为您服务的宗旨。在细胞信号通路、免疫学、蛋白组学上拥有显著优势，其抗体产品、生长因子等为生命科学科研工作者提供了极大的便利。

上海遐锦生物科技有限公司

上海遐锦生物科技有限公司于2019年11月29日举办全国循证医学Meta分析与网状Meta研讨会2019（11月上海班）会议。

会议日程（最终日程以会议现场为准）

全转录组高通量测序&芯片数据生信分析研讨会日程
时间安排		课程表	介绍
第一周	周一 19:00~22:00	生信简介	生物信息介绍
			高通量：测序及芯片介绍非编码RNA的机制、调控模式（miRNA、lncRNA与circRNA）
			经典生信SCI文章的解读，了解TCGA数据库、GEO 数据库这些公共数据的挖掘获得创新结论并发文章的思路。非编码RNA的创新文献解读（含miRNA、lncRNA和circRNA）
		TCGA数据库 NCBI GEO数据库	TCGA数据库：最全的癌症高通量数据公共库(简介)
			TCGA数据库的介绍和使用（包含了转录组、基因组、表观组和临床信息数据）
			GEO数据库介绍：数据量最大的高通量公共数据库。
			GEO数据库的高通量芯片数据查找、筛选、探针转换、差异分析等。
	周三 19:00~22:00	TCGA相关的下载工具	TCGA数据库癌症数据下载：RNA-seq数据、miRNA-seq数据、及临床信息数据的下载 TCGA数据书库癌症数据的处理，获得关键mRNA、miRNA的表达谱矩阵。
		非编码RNA数据库简介	miRNA 注释数据库（注释及序列下载） lncRNA注释数据库（注释及名称转换） circRNA注释数据库
第二周	周一 19:00~22:00	R语言基础	R软件与Rstudio软件下载、安装、界面。 R语言基础：元素、向量、矩阵、数组 R语言函数：计算函数、统计函数等 R语言路径确认及修改 R语言文件（图、表）的导入和导出
		R语言实战	R语言包：包的下载安装 R语言：差异分析limma包使用制作
	周三 19:00~22:00	R语言实战	聚类热图制作 R语言pheatmap包做聚类热图
			R语言ggplot2构建功能气泡图
		基因功能分析	DAVID功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析
			通路map图构建
第三周	周一 19:00~22:00	生物网络分析	蛋白与蛋白互作分析（PPI）——STRING数据库
			cytoscape软件（上）：网络图构建与美化
	周三 19:00~22:00	生物网络分析	cytoscape软件（下）：插件使用
		miRNA分析	差异miRNA分析 miRNA-mRNA数据库（验证和预测结果） miRNA与靶基因结合位点（MRE）分析 VENN图分析癌症的miRNA预后分析
第四周	周一 19:00~22:00	lncRNA分析	miRNA-lncRNA数据库 lncRNA-target分析 lncRNA参与的ceRNA分析共表达分析
		circRNA分析	circRNA-seq高通量测序解读 miRNA-circRNA数据库 circRNA参与ceRNA的分析
	周三 19:00~22:00	全转录组整合思路	ceRNA（竞争性内源RNA）的机制 ceRNA关系对分析 ceRNA网络构建
		结尾	串讲