宏基因组与代谢组/脂质组学R软件数据可视化

研讨会

2022年11月26日 腾讯会议网络会议室

【背景介绍】

微生物是自然界中分布最广、种类最多、数量最大的生物类群。以肠道微生物为例，人体内微生物的总数量约是人体细胞总数的10倍 —— 越来越多的研究发现，肠道微生物与人体健康有着密切的关系，而微生物产生的代谢物是调控过程中最主要的中间递质之一。

宏基因组研究包括16s测序和宏基因组测序，可以获得微生物群落丰度以及组成。通过分析可以获得关键菌群以及功能，为疾病治疗提供研究基础。

代谢组学和脂质组学是基于LC-MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物/脂质分子进行定性和相对定量分析。严格来讲，脂质组也是代谢组的一种。

宏基因组-代谢组/脂质组的联合分析能够从多个维度阐释一个科学问题，可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性，从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系。

基于以上原因，医药加推出“宏基因组+代谢组/脂质组联合分析”R软件实操课程，带您充分挖掘数据，掌握生信高级分析能力。

【主要内容】详细内容见下文日程表

1. 宏基因组生信文章解读与报告解读；
2. R和Rstudio软件安装，宏基因组与代谢组/脂质组学联合分析实操；
3. 生信SCI文章实用数据处理与图片导出。

【会议预期】

通过一天的时间学习数据处理分析及可视化作图，得到SCI水平的图片。

【讲师简介】

宋伟博士

成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。

培训经历：在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场现场培训班。

【会议日程】

示例图展示：

示例图 箱线图

示例图 PCoA图

示例图 物种组成柱状图

示例图 热图

示例图 venn图

示例图 circos环状图

示例图 PCA分析

示例图 桑基图