TCGA&GEO数据分析及癌症预后模型构建靶标筛选研讨会

2023年5月11日、13-14日 腾讯网络会议

背景简介：

随着后基因组时代生信分析方法的不断完善和创新，临床与生信的关联越来越密切。我们可以通过高通量数据快速、准确、创新的筛选到自己课题方向相关的关键靶标以及机制。高通量数据来源广泛，总体分成两类：（1）采集样本进行测序（自有数据）；（2）公共数据库中免费下载高通量数据。

公共数据库的数据样本量大，免费而且选择范围广。常见的数据库有TCGA数据库和NCBI GEO数据库，里面含有大量的不同研究方向的样本高通量数据。

癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加！另外，其他疾病的研究可以通过GEO数据库进行。

本次培训不仅仅要大家了解多种不同的生信分析思路，学会TCGA & GEO数据库的基础操作，比如 数据筛选，下载，差异分析，功能通路分析，预后分析等等，还有复杂的预后模型构建筛选风险基因的实操内容。可以说是基础分析与高级分析并存。

培训班针对生信0基础的学员进行教学，包教包会。

讲师简介：宋伟博士

成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。

培训经历：在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场培训班。

主办方：上海遐锦生物科技有限公司

会议时间：2023年5月11日、13-14日（2天1晚）

第1天 晚上19:00-22:00（线上）

第2、3天 白天9:00-18:00

会议地点：线上：腾讯网络会议室，

线下：中兴和泰酒店 上海市浦东新区科苑路866号

会务费用：3500元/人

优惠政策：

1.提前确认报名及转账的，可以提前拿到学习材料

2.三人组团报名，每人优惠100元

3.四人组团报名，每人优惠200元，

4.六人组团报名缴费，可免1人参会费！

可以开正规会务发票，纸质邀请函（盖红章）。

注意事项：使用win7以上系统的电脑，现场不得录音录像。上课软件为Cytoscape，Heml，GSEA，R和Rstudio。

另外需安装腾讯会议软件。

详细日程参见日程表

通过本次学习，您可以学会以下作图（包括但不限于）

示例图 样本表达箱式图

示例图 差异结果展示：火山图与热图

示例图 关键基因的聚类热图

示例图 通路富集分析结果图

示例图 网络图

示例图 关键基因的KM生存曲线图

示例图 关键基因的突变oncoprint热图

示例图 关键基因的表达箱式图

示例图 venn图

示例图 森林图与lasso回归分析

示例图 模型验证

示例图 列线图