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首页 > 培训课程 > 学术/科研培训 > 紧扣生信热点零基础到手握5+生信热点分文章 培训 更新时间:2022-05-31T16:18:05

紧扣生信热点零基础到手握5+生信热点分文章 培训
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紧扣生信热点零基础到手握5+生信热点分文章 培训 已截止报名

课程时间: 2022-06-11 09:00至 2022-06-12 18:00结束

课程地点: 线上活动 

主办单位: 玮瑜科研平台(上海玮瑜生物科技有限公司)

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        会议介绍

        会议内容 主办方介绍


        紧扣生信热点零基础到手握5+生信热点分文章 培训

        紧扣生信热点零基础到手握5+生信热点分文章 培训宣传图

        紧扣生信热点零基础到手握5+生信热点分文章

        这是史无前例的实战课程,你收获的不只是5天的互动教学课程,

        你收获的是课后11的指导和个人文章批改,是科研思维的洗礼。

        一次报课,一篇文章、终生受益。

        (2022611日-12日线上授课)


        【课程内容】

        1.零基础全面掌握生信核心知识点;

        2.零基础学会SCI模块化写作思路和修稿策略;

        3.极速写一篇SCI论文的核心思维和实操步骤;

        4.零基础极速掌握R语言核心知识点。

        5.百分百的售后,一次授课,终生答疑。


        【授课老师】

        百川,百川科研公众号创建者211/985大学教授,发表SCI文章50余篇,数家SCI杂志审稿人,资深职业写手,擅长SCI文章撰写与修稿,具有多年生信培训经验,学员反响热烈。本次将倾情奉献,从构文思路、到实操步骤、到写作指导、到投稿修稿,提供一站式指导,课程紧紧围绕差异分析、泛癌分析、多组学分析、多芯片联合分析、批量生存分析、信号通路的筛选、蛋白互作、免疫微环境、ceRNA网络、单细胞测序、实验关键基因的筛选、基因Signature的筛选、预测模型的建立、预测模型的评价、LASSO回归、Nomogram诺模图、ROC曲线、以及最新的热点(课上内容)等等进行抽吸剥茧的精讲,现场指导写作,课程结束当天能够写成自己的文章初稿。


        【课程目标】

        1)没有课题时,自己找到课题;没有机制时,自己找到机制;

        2)让自己SCI文章或国自然项目内容更夯实,思路逻辑更完美;

        3)思路缺乏创新性,怎么办?老师给你最新的生信分析热点;

        4)掌握R语言的核心技能,掌握批量分析方法,掌握顶层计算机思维体系;

        5)掌握生信SCI写作思路和修稿思路;

        6)掌握生信分析的独家套路(5个套路供你选择);

        【课程内生信核心内容】

        1)配对/多组差异分析;(2)蛋白质相互作用网络;(3) 免疫微环境;(4ceRNA网络构建;(5)细胞焦亡的分析流程;(6)批量生存分析;(7)预测模型的建立及评价;(8Cytoscape软件精讲;(9)实验基因的寻找与生信验证;(10)单基因泛癌分析;(11)多组学分析;(12)多芯片联合分析;(13)实验信号通路的筛选;(14)基因Signature的构建;(15)生信预测模型的建立;(16)预测模型的评价;(17Cox回归;(18LASSO回归;(19Nomogram诺模图(20ROC曲线;(21)单细胞测序核心知识点;(22)单细胞测序数据的整理;(23)单细胞测序数据的质控;(24)降维分析;(25)聚类分析;(26)单细胞测序细胞亚群的区分;(27)单细胞测序数据的差异分析;(28)单细胞测序细胞群的注释;(29)新的细胞亚群的鉴定;(30)如何结合生信热点发前沿文章。


        【课程安排】


        日期

        课程主要内容

        第1天

        8:30-11:30

        R语言基础知识介绍;R语言读入及读出; R包的多种安装模式; R包及bioconductor资源的使用; R语言数据框的操作; R语言数据结构及循环控制(向量、因子、矩阵、数据库、列表、for循环、if控制);DIY自己的人生第一个批量处理函数; R语言绘图原理及体系;R语言基本绘图和高级绘图精讲及实操;

        GEO数据库介绍、下载、清洗和探针注释;TCGA数据的下载、清洗、不同类型数据的转换

        第1天

        1:30-5:00

        多个GEO芯片联合分析的多种思路;

        GEO芯片的probe探针的转化方法汇总

        差异分析精讲(从表达矩阵的整理、归一化、标准化到差异分析、多组差异分析、配对差异分析)

        差异基因的呈现(精美火山图、热图、PCA图、小提琴图)

        GEO数据的处理流程演示及学员实战(数据清洗、热图、火山图、GO分析、KEGG分析、共表达分析)

        R语言实现生存分析、功能注释(精美生存曲线图)

        GSEA讲解及结果解读(精美GSEA图)

        GSEA分析的全套流程讲解及结果的诠释(精美GSEA图)

        两个基因相关性分析;

        单基因生存分析

        多基因生存分析

        第2天

        8:30-11:30


        任意癌症任意基因在癌和癌旁的表达分析;

        同一癌症不同亚型和不同分期的表达分析;

        单基因在多个正常组织中的表达分析;

        单基因在多个癌组织中的表达分析;

        单基因在多个癌和癌旁中的表达分析;

        预后模型类思路和实操精讲:基因Signature的构建;生信预测模型的建立;预测模型的评价;Cox回归;LASSO回归;Nomogram诺模图;ROC曲线。

        蛋白互作网络构建、cytoscape的实操使用,MCODE的实操;

        cytoHubba实操选取Hub genes(精美蛋白互作图)

        多个GEO数据的分析思维及实操

        第2天

        1:30-5:00

        ceRNA的理论讲解 mRNA incRNA miRNA的获取。ceRNA网络构建,ceRNA网络的验证 ceRNA网络的展示(发表极分子网络)

        免疫微环境的理论讲解,免疫浸润实操:自己测序样本中免疫浸润

        细胞丰度的计算;单基因表达与免疫细胞的影响、单基因突变与免疫细胞的影响、单基因拷贝数对免疫细胞的影响,免疫浸润细胞与临床因素的关系

        单基因泛癌分析、泛癌表达量分析、泛癌生存分析 泛癌基因突变 泛癌免疫分析;

        多组学分析;

        单细胞测序的分析思路及操作流程(单细胞测序核心知识点;单细胞测序数据的整理;单细胞测序数据的质控;降维分析;聚类分析;单细胞测序细胞亚群的区分;单细胞测序数据的差异分析;单细胞测序细胞群的注释;新的细胞亚群的鉴定)

        生信的其他应用(怎么利用TCGA/GEO数据库中找课题?怎么利用TCGA/GEO挖掘下游机制?如何利用TCGA/GEO数据库申请国自然?如何利用TCGA/GEO数据库发表文章?)

        最新热点的分析思路指导(如何结合生信热点发前沿文章)

        SCI文章模块化写作精讲和修稿策略,实例讲解:审稿人让补充实验,如何不做实验也能让审稿人满意。

        实战环节:每个分析步骤的一步一步,“我在讲,你在做,不懂你就问”的DIY环节;



        【涉及的31个议题】

        1,没有课题时,如何找课题、找线索、找机制?

        2,后续细胞实验,如何精准找到下游作用通路或因子?

        3,花钱测序回来的一堆结果,乱七八糟,怎么梳理、再分析成一篇SCI论文?

        4gene signature类文章的一些禁忌,哪些是评审专家特别看重,一票否决的点?

        5,当下热门的免疫微环境是怎么回事,怎么利用自己的数据进行操作?

        6,审稿人说只有生信分析,没有实验验证,怎么办?,

        7, TCGA数据库中的数据,怎么下载,需要进行哪些数据清洗?

        8,文章写好了,怎么选刊,避免踩雷?

        9WGCNA是什么东西,为什么是生信分析的神器?

        10,生存分析有几种方案?怎么进行批量操作?

        11,免疫浸润的计算方法有多少种,怎么多种方法批量分析?

        12,目前有什么热点,怎么结合热点,发出不一样的生信文章?

        13,单基因生信分析,能做到什么程度?

        14,两个基因,能进行什么生信分析,产生多少结果用于SCI文章中?

        15,一群基因,能进行什么生信分析,产生多少结果用于SCI文章中?

        16,如何利用生信挖掘,没有试验前期,也能写课题中标书?

        17,差异表达分析怎么做、配对样本怎么做,多组样本怎么做,小样本怎么做,大样本怎么做?

        18GSEA基因集富集分析,优点是什么,缺点是什么,怎么做?CNS的大牛文章中到底是怎么用GSEA的?怎么在文章或课题里利用GSEA加分?

        19ceRNA网络怎么构建? 对于mRNAmiRNAlncRNAcirRNA,我们应该做些什么?

        20GE0芯片数据,除了热图、火山图,还能做什么?

        21,那么多GEO平台,如何以不变应万变的进行探针ID转换?

        22GEO多芯片数据,如何进行批次效应的处理?

        23ssGSEA算是批次效应的终结者吗?批次效应的终结者到底是什么?

        24,如何对长链非编码RNA、假基因等一网打尽的注释?

        25,单基因GSEA怎么做?有什么用途?跑出的结果怎么挑选和分析?

        26TCGA数据的正常和癌组织怎么分组,转移和未转移怎么分组,配对样本怎么挑选?

        27,如何从TCGA数据中提取出lncRNA

        28,同一基因出现不同的分析结果,我该信谁?

        29,做通路分析时,肺癌的数据聚类出肝癌的通路,这是怎么回事?

        30,我想进一步学习,但害怕四处折腾踩雷,有什么避雷指南?

        31,别人生信学3个月或学半年,我怎么学,才能后来居上,超过他们?


        【主办单位】

        玮瑜科研平台(上海玮瑜生物科技有限公司)

        【承办单位】

        上海玮瑜生物科技有限公司

        上海玮瑜信息科技有限公司

        【培训时间】

        2022611-12日开始 线上

        【注册费用】

        注册费用:3200/

        可开会务、注册、检测、分析服务等发票

        查看更多

        玮瑜科研平台(上海玮瑜生物科技有限公司) 玮瑜科研平台(上海玮瑜生物科技有限公司)

        玮瑜科研平台(上海玮瑜生物科技有限公司)于2019年12月28日举办2019转录组测序数据分析及案例实践培训班(12月上海班)。

        会议日程


        即将更新,敬请期待

        会议嘉宾


        即将更新,敬请期待

        参会指南

        会议门票


        票种名称 价格 原价 票价说明
        会务费 ¥3200 ¥

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        酒店与住宿: 为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
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