生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班
时间:2017-06-26 09:30 至 2017-06-28 17:00
地点:北京
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生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班 已截止报名会议时间: 2017-06-26 09:30至 2017-06-28 17:00结束 会议地点: 北京 北科产业3号楼 北京市海淀区丰贤中路7号 周边酒店预订 主办单位: 北京市计算中心
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会议介绍
会议内容 主办方介绍
生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班宣传图
Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!
举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间:2017年6月26日-28日 (报名中)上午9:30-12:00,下午13:30-17:00
【培训特色】
1、对口生物信息;
2、非严格语法,适合初学;
3、功能强大、跨平台;
4、有巨大的第三方代码库CPAN
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北京市计算中心建立于一九七三年,是国内最早一批计算中心之一,是中国最早、最具影响力的从事计算机应用技术研究及推广的机构,服务对象则涉及工业、商业、交通、能源、环保金融、税务、社会事务等多个领域。北京市计算中心自成立以来,完成了上百项国家和北京市政府有关部门委托的研究项目和面向多种用户的服务型项目。先后获得国家及省部级成果奖30多项、,拥有了200余项国际国内领先的技术和产品,为中国计算机的普及、应用和发展做出了杰出贡献[1] 。 1978年,北京市计算中心同联合国开发署合作,在计算机领域首开国际合作之先河。1979年开始执行联合国开发计划署援助的国家项目,五年间积累了丰富的国际合作经验。1990年,承担了第11届北京亚运会计算机工程项目,荣获北京市科技进步特等奖。设计了全国第三次人口普查、铁路物资调运优化方案等。30余年来,北京市计算中心为政府、企业、社会做了大量的工作,近年来,经过不断改革、发展,发挥大规模计算的优势服务于各行各业,拥有数十家企业,三个研究机构(包括两个重点实验室),并成为中国高性能计算机产业联盟的依托单位。北京市计算中心具有国内最高水平的公共计算服务能力,主要特色和优势研究领域包括公共计算服务、虚拟仿真、互联网搜索与挖掘、无线传感器网络等。
会议日程 (最终日程以会议现场为准)
培训内容及安排:
日期 |
授课题目 |
授课内容 |
第一天 |
概述 |
1. 生物信息学数据处理概述; 2. Perl语言简介特点与数据处理的优势与应用范围 |
运行调试 |
3. Perl语言解释器、编辑器安装; 4. Perl运行环境测试与程序编写; 5. UltraEdit软件应用与生物信息学数据文件处理; 6. 基于宏的perl语言快速编程 |
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操作基础 |
7. Perl语言基本变量、操作符、判断结构;循环结构; 8. Perl语言常用函数的功能应用; 9. 生物学数据文件的读入与输出; 10. 生物信息学常见文件的分割、合并、过滤、信息提取等; 11. 批量自动化数据文件操作 |
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第二天 |
生物信息实例应用 |
12. 常用生物信息学数据文件格式简介; 13. 用perl从NCBI、ENA等数据库批量下载基因序列; 14. 用perl进行生物学数据文件格式转化; 15. 用perl编程从Fasta、GBK、Fastq、PDB等提取关键生物学数据信息; 16. 用perl批量自动化下载基因序列; 17. 用perl进行DNA到protein批量翻译; 18. 用perl批量DNA序列反向互补; |
高级数据处理 |
19. Perl语言的数组、二维数组、hash表用法; 20. 用perl自动化从表格数据提取信息; 21. 矩阵数据文件的生成与应用 22. 二代测序NGS、GWAS等生物信息分析中perl的应用 |
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第三天 |
模块与子程序 |
23. perl子程序与模块应用; 24. 强大的正则表达式的应用; 25. 用perl进行基因ID列表比较、筛选与统计; |
Perl的高级应用 |
26. Perl第三方代码库CPAN的简介与应用; 27. Bioperl模块与应用; 28. 常用生物信息学程序实例; 29. 用perl进行批量自动化本地blast比对及数据分析; 30. 基于perl的circos基因组作图工具介绍; |
(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)
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会议嘉宾
参会指南
会议门票 场馆介绍
注册费:3000元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少400元;
2、4+1团报,可免费赠送一个名额
3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
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北京中关村永丰高新技术产业基地位于海淀区北清路99号。按不同的用地性质规划为4个工业生产区、一个公共服务中心和一个生活居住区。规划建筑面积386.85万平方米,规划绿地率35%,总容积率0.99。基地内科研、工业区用地207.16公顷,重点吸纳新材料产业、信息产业、生物工程与新医药产业、环保及资源综合利用产业、光机电一体化产业、空间技术产业等经济效益好、科技附加值高、技术密集的绿色环保无污染的高新技术产业。科研、工业1区位于基地西北部,用地面积82.68公顷,划分为77个地块,计划发展成为以纳米材料技术产业、超导材料技术产业、砷化镓和镁合金技术产业为主导的新材料产业园区。
温馨提示
酒店与住宿:
为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
退款规则:
活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。
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