参会报名
会议通知
会议日程
会议嘉宾
参会指南
手机下单

首页 > 培训课程 > 学术/科研培训 > 用R语言挖掘公共数据库（TCGA、GEO）发表高分文章（6.6-7 网络精讲班）更新时间：2020-05-15T11:52:52

收藏3人

分享到

用R语言挖掘公共数据库（TCGA、GEO）发表高分文章（6.6-7 网络精讲班）已截止报名
推荐参加：2025年科技项目申报与科研平台建设运行、经费使用管理、综合绩效评价专题培训班(1月南京)

课程时间： 2020-06-06 08:30至 2020-06-07 17:00结束

课程地点：线上活动

会议规模：50人

主办单位：上海莫速乎教育投资有限公司

行业热销热门关注看了又看换一换

会议通知
会议内容主办方介绍

用R语言挖掘公共数据库（TCGA、GEO）发表高分文章（6.6-7 网络精讲班）宣传图

用R语言进行科研数据挖掘实战会议

无实验无数据没关系，挖掘别人的数据，发表自己的文章

两天一夜高强度实训，讲究实战，所有经验和盘托出

会后赠讲课录像便于反复复习保障效果（加密播放不零售，保障学员优势权利）

第十八期 2020/6/6-7 网络精讲班（会议时间两天&一晚）

莫速乎科研会议平台主办，微信搜索：莫速乎教育公众号上可查看带图的会议介绍

还在认为没有实验就不能发表论文？还在为不精通挖掘GEO，TCGA，SEER的数据库而痛苦不堪？还在为不知道如何找课题找靶点而苦恼？还在为不会那些高大上的图表而暗自伤神？快来参加莫速乎的科研数据挖掘实战专题学习班吧，挖掘别人的数据，发表自己的文章，一次学习，不再报班！

本会议由于带着明确的目的性去学习R语言，且针对有/无R语言基础的学员均具有很大宽容性，自开班起就广受好评。随着近年来生物信息学技术的普及，R语言是每个科研工作者都有必要掌握的技能，以往漫无目的的学习R效果不理想，用R去进行科研数据挖掘，既学习了R又解决了实际科研问题。

学完课程并掌握后能干什么：

1.没有课题的时候找到课题，没有机制的时候挖掘机制

2.为基金申请保驾护航，发表paper如虎添翼

3.掌握R语言的核心技能，GEO，TCGA，SEER的数据处理没有压力

4.科研绘图：以一敌百，高端大气，私人订制。

这是一份带有诚意且注重实战的数据挖掘课程。我们的目标是：一次学习，不再报班。

课程特点：

1.不留秘密，私货全出，全程只用R语言，关键步骤不隐藏。

2.第一天晚上时间充分利用，增加带有讲师指导的练习，更多的训练时间，更好的掌握。

3.讲最核心的知识，讲通用的技能，学后可应用到其他数据库的挖掘。

4.实例操作(至少3个套路)，让你快速掌握数据挖掘套路。

5.现场完成一篇paper的思路以及图表。

适合人群：

广大临床/科研工作者及心有热血被困囚笼的研究生

上海莫速乎教育投资有限公司

莫速乎科研教育，简称莫速乎，原名“多圈课堂”，创立于2012年12月，隶属于上海莫速乎教育投资有限公司。2014年3月更名为“莫速乎科研教育”，品牌名源于我国古代著名教育家《荀子·劝学》“学之经莫速乎”。莫速乎旨在通过独创的EAT理念打造最易接收并最能提高实际技能的高清视频课程，以作为科研传统教育的补充或替代。同时将持续开展现场研讨班，以弥补视频课程之不足。EAT理念以荀子思想为根基，并从“学”的角度优化教学，且课程策划符合哲学的认识论规律，是目前“最符合人性”的教学理念。在课程策划方面，我们坚信每个小领域只需要一部课程，一部优秀的课程，经典的课程，足可供全国千百万人学习，莫速乎正是立志于打造每个小领域内的这一部课程。

会议日程（最终日程以会议现场为准）

日期	时间	内容安排
第一天	08:30-11:55	R语言基础知识介绍 R语言数据结构以及循环控制(向量，因子，矩阵，数据框，列表,for循环，if控制) 编写自己的第一个批量处理数据的程序 R语言中数据框的操作(增删改查) 真实数据的清洗和整理 R包以及bioconductor资源的使用 R包无敌安装攻略 R语言绘图系统






	11:55-13:30	统一午餐
	13:30-17:00	TCGA数据库背景介绍+阅读文献 TCGA相关的网页工具汇总学习介绍不同的癌症和不同组学不同的分析套路解读(WGCNA，signatures，miRNA-mRNA配对或者ceRNA等) TCGA数据分析的软硬件准备下载及理解TCGA数据(所有数据) R制作TCGA表型数据临床三线表





	17:00-18:00	统一晚餐
晚上	18:00-21:00	R语言数据框的操作练习(掌握tidyr和dplyr) GEO数据库成套流程实战（数据清洗，热图，火山图，气泡图）如何根据需求绘制一个漂亮的火山图(学习ggplot2) 使用R语言制作特定肿瘤所有基因表达的数据库第一天答疑，消化，为第二天做准备


第二天	08:30-11:55	差异分析(表达数据，表达矩阵归一化，DESeq2) 任意癌症任意基因在癌和癌旁的表达如果有亚型，在不同亚型中的表达如果有肿瘤有分期，在不同临床分期中的表达单个基因在多个正常组织中的表达单个基因在多个细胞系中的表达单个基因在多个肿瘤中的表达两个基因的相关性如何分析
		聚类注释与图表展示 (GO/KEGG,GSEA)
		使用多种统计算法定位 signatures cox,lasso回归
		生存分析绘图美化任意癌症中任意基因的生存分析任意癌症中批量生存分析
		TCGA文章的框架分析以及复现
		答疑环节
	11:55-13:00	统一午餐
	13:00-16:30	利用GEO和TCGA数据库找到课题利用GEO和TCGA数据库发掘下游机制如何利用GEO和TCGA数据库申请基金如何利用GEO和TCGA数据库发表文章现场完成一篇生信文章的所有图表提出科研假设根据科研假设下载整理数据导入R语言在R语言中清洗和整理数据达到对应R包的要求数据处理过程中调整分析策略绘制各个部分需要的图标