多组学数据整合挖掘与分析（网络）研讨会2021年6月线上及上海培训班已截止报名
推荐参加：世界中医药学会联合会中医特色诊疗研究专业委员会第16届中医特色诊疗国际学术年会

课程时间： 2021-06-18 09:00至 2021-06-20 18:00结束

课程地点：北京中兴和泰酒店上海浦东新区张江高科技园区科苑路866号周边酒店预订

主办单位：上海遐锦生物科技有限公司

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会议介绍
会议内容主办方介绍

多组学数据整合挖掘与分析（网络）研讨会2021年6月线上及上海培训班宣传图

组学数据整合挖掘与分析（网络）研讨会

2021年6月18-20日腾讯会议网络会议室/中兴和泰酒店

【背景介绍】

2019年度国家自然基金医学科学部共批资助10138项目，批助金额总计441310万元。这些项目中大部分都与编码基因有直接或间接的关联。其中，与通路（pathway）关联的有1349项，金额4.89亿；与miRNA相关的有630项，金额2.3亿；与lncRNA相关的有395项，金额1.45亿，与甲基化相关的有213项，金额8748万，与突变相关的有190项，金额7410万；

如何获得有创新意义的疾病靶标基因（mRNA，Protein，lncRNA，circRNA，miRNA，Mutation等）是项目申请及文章写作时最常见的问题。

目前，多组学整合分析是一个非常热门且创新的方向。通过多组学整合分析我们可以更加快速、准确的找到与研究方向关联的biomarks。它的核心原理是期望通过高通量数据，找到所有基因在不同组学水平中的变化并进行分析，获得关键基因在各个组学都有显著作用。

多组学整合分析的原始数据来源有两种：（1）自己采集样本做高通量测序/芯片/质谱等；（2）使用公共数据库中的组学数据（比如TCGA、GEO、EBI、SRA、CGGA、PRIDE等）。

【主要内容】详细内容见下文日程表

多组学分析常用数据库；
多组学分析常用软件和工具；
教授对应的图片制作方法（包含但不限于聚类热图、火山图、富集分析图、Venn图、pathwaymap）

【会议预期】

通过三天的学习，了解多组学整合分析思路对项目及文章的帮助，以及实操常见的数据库、在线工具和本地软件。使得学员可以自己完成一个完整的分析报告并获得疾病相关的靶标基因。

多组学数据整合挖掘与分析（网络）研讨会2021年6月线上及上海培训班

上海遐锦生物科技有限公司

上海遐锦生物科技有限公司于2019年11月29日举办全国循证医学Meta分析与网状Meta研讨会2019（11月上海班）会议。

会议日程（最终日程以会议现场为准）

日期	时间	大纲	详细内容
第一天	9:00-10:30	第1节：组学简介及生信概述	2019年国自然中组学相关项目解读
			组学原始数据的来源及质量判断
			高通量：测序及芯片介绍——不同组学：转录组学、基因组学、表观组学、顺反组学、宏基因组学等。
			文献案例解读
	10:30-10:45
	10:45-12:00	第2节：软件安装 R包安装	R简介及R包安装 R基础讲解 R函数 R包
	12:00-13:30	午餐及午休
	13:30- 14:30	第3节：组学公共数据库	TCGA数据库：最全的癌症高通量数据公共库(简介)及数据下载
			GEO数据库的高通量数据查找、筛选、数据下载
			EBI数据库的高通量数据查找、筛选、数据下载
			GEO2R工具使用
	14:30-14:45	休息
	14:45-17:30	第4节：转录组差异基因筛选及功能富集分析	计算差异基因 -R limma包或Excel公式
			主成分分析（PCA)图制作
			聚类热图（heatmap）的制作——R pheatmap包
			火山图（volcanoPlot）——R ggplot2包或 Excel制作
			箱式图（代码或无代码制作）
			R clusterProfiler包富集分析
			基因/蛋白功能富集分析——DAVID工具
			功能富集分析柱状图、条形图、气泡图、饼状图的R代码及Excel制作

第二天	8:30-10:30	第5节：多组学数据与临床预后分析	基因突变分析工具——cbioportal
			在线预后分析工具——Ualcan
	10:30-10:45	休息
	10:45-12:00		本地生成KM曲线图——R survival包
			相关性分析及散点图制作
	12:00-13:30	午餐及午休
	13:30-15:00	第6节：转录组与蛋白组整合分析	Venn 图制作
			蛋白与蛋白互作关系预测——STRING工具
	15:00-15:15	休息
	15:15-17:30		网络图构建与美化——cytoscape软件
			转录组与蛋白组整合关联分析思路文章实现

第三天	8:30-10:00	第7节：蛋白组与代谢组整合分析	代谢物功能富集分析——metaboanalyst工具
			KEGG 数据库介绍及使用
			pathway map制作
			蛋白组与代谢组整合分析思路文章实现
	10:00-10:15	休息
	10:15-12:00	第8节：全转录组整合分析	各类RNA简介及ceRNA介绍
			miRNA测序报告解读
			circRNA测序报告解读
			miRNA分析工具
			lncRNA分析工具
	12:00-13:30	午餐及午休
	13:30-15:30	第9节：其他组学整合思路	肠道菌群宏基因组与代谢组
			表观组与转录组整合
	15:30-15:45	休息
	15:45-16:00	总结	总结及答疑