第10期测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班2019（1月上海班）
时间：2019-01-12 08:00 至 2019-01-13 18:00
地点：上海
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第10期测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班2019（1月上海班） 已截止报名
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会议介绍
会议内容 主办方介绍
第10期测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班2019（1月上海班）宣传图
第10期测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班
上海班：2019/1/12-13 （11号报到）
上海好望角饭店
注意事项：携带windows系统的电脑，苹果电脑请务必提前做好双系统。现场不得录音录像。
通过该主题的学习，可以学会：
高通量公共数据的详细信息查找/下载；
在线做差异表达分析
在线blast分析
基因ID转换
通路map图制作
功能富集分析
蛋白互作分析
网络图的构建和美化。
学习班简介
高通量数据挖掘与分析是基于生信的方法从芯片及测序高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因（mRNA，miRNA，lncRNA或蛋白）。随着高通量手段的不断进步，测序和芯片的成本也逐渐降低，速度也越来越快，使用高通量手段（测序/芯片）进行科研的优点非常明显，也是大势所趋！
做过测序或者芯片实验的科研人员越来越多，虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析，比如过滤、质控比对、定量和差异等，但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析，并不能完整的讲一个故事！我们也很难在大量的差异基因中筛选获得关键基因。因此，需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力，从海量信息中获得自己想要的关键基因！
培训目的与培训预期
培训目的：很多学员都做过测序或者芯片实验，虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析，比如过滤、质控、比对、定量和差异等，但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析，并不能完整的讲一个故事！因此，需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力，从海量信息中获得自己想要的关键基因！
培训预期：通过2天的培训（半天理论课程+1天半实践操作），使学员掌握生信文献分析思路和8个实用操作知识点（具体见最后），可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。
培训时间与培训地点
培训时间：2019/1/12-13 （11号报到）
培训地点：上海好望角饭店 上海市徐汇区肇嘉浜路500号5楼会议室
学习班组织方
主办方：医药加科研培训中心
承办方：上海遐锦生物科技有限公司
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南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd），是专一服务于生命科学研究的专业技术型企业。是一大批志同道合的资深专业人士共同创办的具有现代化经营管理水平的生物高科技企业，从事生物技术产品的开发及销售，致力于将巴傲得生物打造成中国乃至世界一流的生物技术产品供应商。巴傲得生物长期备有Bioworld抗体现货4000多种抗体可以在一周左右送到客户的手里。精湛品质、合理价格、专业服务，是我们为您服务的宗旨。在细胞信号通路、免疫学、蛋白组学上拥有显著优势，其抗体产品、生长因子等为生命科学科研工作者提供了极大的便利。
医药加科研培训中心
举办了2018肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议（12月北京班） 2019临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班（01.05-01.06北京班） 2019全国循证医学Meta分析及网状Meta三天精讲学习班（1月北京班） 第10期测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班2019（1月上海班） 2019肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议（1月上海班） 2019国自然基金标书构思与撰写学习班（1月上海班） TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班2019（1月上海班） 第8期医学SCI论文写作及发表技巧学习班2019（1月上海班） ......
会议日程
（最终日程以会议现场为准）
课程具体安排
1、理论课程：第一天上午
8.30-10：00第一节：基因数据库使用介绍
测序标准报告的解读。
NCBI Gene数据库：最权威的基因综合数据库之一。
NCBI GEO数据库： 数据量最大的高通量公共数据库。
GEO2R工具：在线做差异分析的R工具
bioDBnet：在线基因ID转换工具。
Uniprot： 最权威的蛋白综合数据库之一。
10.15-12：00第二节： DAVID工具——功能富集分析
功能富集的原理和意义
基因ID转换
基因功能注释（GO ，KEGG pathway）
基因功能富集（GO ，KEGG pathway）
基因功能聚类（GO ，KEGG pathway）
2、实践操作课程（共1天半）
第一天下午
13：30-17:30第三节 聚类热图及pathway map图
KEGG 数据库：最权威的通路数据库（pathway map 分析）
HEMI软件：构建聚类热图的本地软件
第二天上午
8:30-10:00第四节. STRING工具——基因/蛋白相互作用分析（PPI）
蛋白互作分析的原理和意义；
单个蛋白的蛋白互作分析；
多个蛋白的蛋白互作分析；
STRING工具的使用步骤：输入、参数设置、输出等。
10:15-12:00第五节 cytoscape网络做图软件（上）
网络图构建
逐个修改节点的属性和修改边的属性
网络展示方式layout更美观
网络统计分析
13:30-15:30第六节 cytoscape网络做图软件（下）
批量修改节点的属性和修改边的属性
Cytoscape的常用插件：ClusterONE
Cytoscape的常用插件：BinGO
15:30-17:00 答疑环节
通过该主题的学习，可以学会：
高通量公共数据的详细信息查找/下载；
在线做差异表达分析
在线blast分析
基因ID转换
通路map图制作
功能富集分析
蛋白互作分析
网络图的构建和美化。
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会议嘉宾
（最终出席嘉宾以会议现场为准）
讲师简介
宋伟博士
成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。
培训经历：在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有：医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。
培训方向：《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等
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参会指南
会议门票 场馆介绍
学习费2800元每位（学习费包含电子版教材、午餐，住宿费自理，保证学员完全掌握。）
优惠政策：
1. 提前支付转账的可提前拿到学习资料
2. 三人组团报名，每人收费2700元
3. 四人组团报名，每人收费2600元
4. 五人组团报名缴费，额外带一人免费注册！
5. 参加过医药加TCGA/GEO数据挖掘的学员只要再支付1000元
可以开正规会务发票，纸质邀请函（盖红章）。
注意事项：携带windows系统的电脑，苹果电脑请务必提前做好双系统。现场不得录音录像。
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上海好望角大饭店
交通指南：
打浦桥地区
驾车距离2.3公里（约4份钟）
浦东国际机场
驾车距离41.5公里（约58分钟）
虹桥国际机场
驾车距离15.0公里（约22分钟）
虹桥火车站
驾车距离16.6公里（约29分钟）
上海火车站
驾车距离6.4公里（约13分钟）
市中心
驾车距离5.公里（约11分钟）
豫园
驾车距离5.5公里（约12分钟）
南京路步行街
驾车距离5.5公里（约11分钟）
上海好望角大饭店位于上海徐家汇附近的繁华地带，是全国科技系统首家涉外接待单位。
上海好望角大饭店是集会议、住宿、餐饮、健身、商务、娱乐、购物等功能于一体的一座现代化的会议大厦。
饭店所配备的现代化硬件设施和相配套的软件系统，不仅是中国科学院对外进行学术交流和接待国内外科学家、教授、学者的窗口，也是海内外商务或旅游宾客来沪下榻的理想饭店之一。
饭店客房的设计和布置根据科学家和商务客人的生活需要而特意安排的，房间内生活功能一应俱全，小巧而卫生，精致而儒雅是好望角客房的特色之一。优质的居住氛围和专业的商务配备，是宾客放松身心、办公洽谈的理想之地。
温馨提示
酒店与住宿:
为防止极端情况下活动延期或取消，建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后，再安排出行与住宿。
退款规则:
活动各项资源需提前采购，购票后不支持退款，可以换人参加。
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