TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班2019（1月上海班）已截止报名
推荐参加：2025（第七届）世界细胞治疗与再生医学大会暨展览会

会议时间： 2019-01-19 08:00至 2019-01-20 18:00结束

会议地点：上海上海浦东中兴和泰酒店浦东新区科苑路866号周边酒店预订

主办单位：上海遐永医药科技医药加科研培训中心

行业热销热门关注看了又看换一换

会议介绍
会议内容主办方介绍

TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班2019（1月上海班）宣传图

TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班

2019/1/19-20（18号报到）

上海浦东中兴和泰酒店

注意事项：携带windows系统的电脑，苹果电脑请务必提前做好双系统。现场不得录音录像。

培训目的与培训预期

培训简介：

癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向（含30000个样本）的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加！如图1所示。

TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班2019（1月上海班）

图1 基于 pubmed数据库检索的包含“TCGA”发表的SCI 文章数量（2018年11月7日）

关键靶标分析是指基于生信的方法从高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因（mRNA，miRNA，lncRNA或蛋白）。

因此，需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力以及逻辑性的生信分析思路，从海量信息中获得自己想要的关键基因！

培训预期：

1. 通过整整两天的培训，掌握TCGA，GEO数据库的使用、下载及分析思路和实用操作知识点。

2. 可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。

3. 课后还可以赠送1小时的全场串联视频，用于学员的复习。

4. 赠送一份最近5年的高价值国自然标书（医药加高价值标书库里面选择）

5. 讲师团队赠送TCGA数据库甲基化，基因表达谱整合分析报告与疾病mRNA+lncRNA分析报告

学习班组织方

主办方：医药加平台

承办方：上海遐永医药科技有限公司

上海遐永医药科技

南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd），是专一服务于生命科学研究的专业技术型企业。是一大批志同道合的资深专业人士共同创办的具有现代化经营管理水平的生物高科技企业，从事生物技术产品的开发及销售，致力于将巴傲得生物打造成中国乃至世界一流的生物技术产品供应商。巴傲得生物长期备有Bioworld抗体现货4000多种抗体可以在一周左右送到客户的手里。精湛品质、合理价格、专业服务，是我们为您服务的宗旨。在细胞信号通路、免疫学、蛋白组学上拥有显著优势，其抗体产品、生长因子等为生命科学科研工作者提供了极大的便利。

医药加科研培训中心

举办了2018肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议（12月北京班） 2019临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班（01.05-01.06北京班） 2019全国循证医学Meta分析及网状Meta三天精讲学习班（1月北京班）第10期测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班2019（1月上海班） 2019肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议（1月上海班） 2019国自然基金标书构思与撰写学习班（1月上海班） TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班2019（1月上海班）第8期医学SCI论文写作及发表技巧学习班2019（1月上海班） ......

会议日程（最终日程以会议现场为准）

注意事项：携带windows系统的电脑，苹果电脑请务必提前做好双系统。现场不得录音录像。

时间安排		课程表	介绍
第一天	9:00~10:00	生信简介	生物信息介绍
			高通量：测序及芯片介绍——不同组学：转录组学、基因组学、表观组学、顺反组学、宏基因组学等。
			经典生信SCI文章的解读，了解TCGA数据库、GEO 数据库这些公共数据的挖掘获得创新结论并发文章的思路。
	10:15~12:00	TCGA数据库 NCBI GEO数据库	TCGA数据库：最全的癌症高通量数据公共库(简介)
			TCGA数据库的产生过程
			TCGA数据库的介绍和使用（包含了转录组、基因组、表观组和临床信息数据）
			GEO数据库介绍：数据量最大的高通量公共数据库。
			GEO数据库的高通量芯片数据查找、筛选、探针转换、差异分析等。
	13:30~15:00	TCGA相关的下载工具	TCGA数据库癌症数据下载：RNA-seq数据、miRNA-seq数据、甲基化数据、基因组数据及临床信息数据的下载 TCGA数据书库癌症数据的处理，获得关键mRNA、miRNA的表达谱矩阵。
	15:20~17:00	TCGA相关的分析工具	TCGA数据分析——突变分析、差异分析、关联分析、生存分析、miRNA调控靶基因分析等。获得生存曲线图（KM曲线，分为临床因素和基因表达两种KM曲线） miRNA靶基因结合位点。
第二天	8:30~12:00	TCGA数据的后续高级分析工具实战	功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析
			通路map图构建
			聚类热图制作
			蛋白互作分析（PPI）及网络图构建
			网络分析及hub蛋白/基因获得。

	13:30~15:00	TCGA数据库与GEO数据库挖掘	基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全转录组整合分析思路演练
			基于TCGA的甲基化与转录组整合分析思路演练
			基于TCGA的基因组与转录组整合分析思路演练
			基于GEO数据库多套数据整合（meta）分析思路演练
	15:20~16:30	整体演练	在电脑上快速完成从头到尾的一套数据实战，及答疑