背景介绍：

以往的TCGA课程往往侧重于R语言程序的讲解，不少学员反应难以掌握。本课程立足应用和实战，宗旨是“临床医生听得懂、学得会，科研人员亦有收获”。本课程将从临床应用视角介绍癌症公共数据库TCGA、SEER的基本情况、数据库结构、数据获取方式及基本统计方法等，深度解析近年讲课人发表的基于TCGA和SEER数据挖掘的经典案例，重点对癌症公共数据库的数据挖掘和课题设计进行讨论，最后也将探讨在此基础上的基金申请、SCI论文撰写策略；

媒体支持： 医小白临床科研一体化服务平台

主办单位： 郑州哈克利生物科技有限公司

培训时间：2021年7月31日-8月1日（共两天）上午：9:30-12：00 下午：14:00-17:30

培训地点：线下：河南*郑州（鑫地酒店）   线上：医小白腾讯会议室

教学特色：

1、原理深入浅出的讲解；

2、技巧方法讲解，提供所有案例数据及代码；

3、与项目案例相结合讲解实现方法，对接实际工作应用 ；

4、跟学上机操作、独立完成案例操作练习、全程问题跟踪解析；

5、课程结束专属助学群辅助巩固学习及实际工作应用交流，不定期召开线上答疑；

主讲专家：

本次主讲老师是来自国内知名三甲医院肿瘤专业的临床医生和科研工作者，有着丰富的临床和转化研究经验。以一作和通讯作者发表SCI论文26篇，10分以上论文8篇，累计影响因子266。其中成功用TCGA、SEER数据库发表十几篇SCI，平均影响因子4.6分一篇。目前主持多项国家自然科学基金，担任一本SCI杂志的Section editor，以及多本影响因子5分以上SCI杂志审稿人。

课程安排：

第一天：医院数据库和TCGA数据库的介绍及应用

1.基于医院数据库的回顾性临床研究设计

2.基于医院数据库的转化研究设计：发挥临床资源优势，结合热点技术

3.TCGA数据库的介绍及应用

（1）讲课人发表的基于TCGA文章的案例的整体思路分析

（2）数据获取：TCGA数据获取方法（下载单样本数据与汇总数据表）

（3）数据分析（电脑实战）：（以讲者文章为案例）

a) 如何实现TCGA原始数据的整理

b) 如何使用Excel进行不同数据表的拼接

c) 如何在整理数据表基础上进行统计分析和作图

（4）利用R程序进行TCGA数据挖掘（电脑实战）：（以讲者文章为案例）

a) R语言基础知识

b) 如何利用R程序实现单个样本文件的拼接和计算

c) 如何利用R程序进行图形制作

d) 如何利用R程序制作nomogram

（5）如何利用TCGA数据撰写论文？

第二天：SEER数据库的介绍及应用

1.讲课人发表的基于SEER数据库文章的思路解析

2.SEER数据库基本概念介绍（数据构成、变量类型）

3.数据获取：如何获取SEER数据

4.上机操作实战：SEER软件安装、权限申请

5.上机操作实战（以讲者文章为案例）：SEER数据库注册、数据获得、处理和分析

6.还原一篇基于SEER数据库发表文章的统计分析流程

7.如何撰写SCI论文并与编辑、审稿人高效沟通

备注：自备WINDOWS操作系统笔记本电脑，需要SPSS、R/R studio、GraphPad Prism、SEER*Stat以及Office Excel 2007以上版本等软件。（报名成功后，会务组会提供相关软件安装包；）