中国生物发酵产业协会前身中国发酵工业协会，经民政部于1990年1月批准成立，主管部门为国资委，为国家一级协会，2011年9月正式更名为中国生物发酵产业协会。协会是应用生物技术的发酵工业生产企业、科研院校、设计安装、设备制造及与发酵行业相关的企业、事业单位自愿参加共同组成并为其服务的社会团体；是跨地区、跨部门、不分所有制形式的全行业组织；是会员利益的共同代表；是具有独立法人资格的社会团体。
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