首都医科大学现有附属医院20家,分别是:首都医科大学宣武医院(第一临床医学院)、首都医科大学附属北京友谊医院(第二临床医学院)、首都医科大学附属北京朝阳医院(第三临床医学院)、首都医科大学附属北京同仁医院(第四临床医学院)、首都医科大学附属北京天坛医院(第五临床医学院)、 首都医科大学附属北京安贞医院(第六临床医学院)、首都医科大学附属复兴医院(第八临床医学院)、首都医科大学附属北京佑安医院(第九临床医学院)、首都医科大学附属北京胸科医院(第十临床医学院)、首都医科大学北京三博脑科医院(第十一临床医学院)、首都医科大学附属北京地坛医院(第十二临床医学院)、首都医科大学附属北京儿童医院(儿科医学院)、首都医科大学附属北京口腔医院(口腔医学院)、首都医科大学附属北京安定医院(精神卫生学院)、首都医科大学附属北京妇产医院(妇产医学院)、首都医科大学附属北京中医医院(中医药临床医学院)、首都医科大学附属北京世纪坛医院(肿瘤医学院)、首都医科大学附属北京康复医院(北京康复医学院)。